同治六年（公元1867年）正月初一，左宗棠接到六百里快马递到的圣谕：“陕甘总督、一等恪靖伯左宗棠，着授为钦差大臣，督办陕甘军务。钦此。”

    显然，为事权归一，朝廷经过反复考虑之后，不得不把“钦差大臣”职衔授给左宗棠，以便左宗棠能在粮饷募勇之事料理完备后，尽早入陕，扭转陕甘的被动局面。

    接旨不久，左宗棠又收到杨岳斌及刘蓉快马送到的信函各一件。

    杨岳斌在函中向左宗棠通报，老湘军统领刘松山所统带部队十七营，马队三起，已飞速抵陕并解除西安之围，并通报鲍超各营，因粮饷尚未备齐加之鲍超本人旧病复发，全队尚未开拔的实情。

    刘蓉则向左宗棠讲述了因乔松年掣肘，致使“月饷欠悬，饥寒交迫，死者无葬埋之费，伤者无医药之资，各军将领日来弟寓泣诉”的窘境。读过刘蓉的信，左宗棠气得一夜未眠，他暗道：“陕省局面坏得如此之快，全系乔松年滞怠饷糈所至！”

    所幸刘松山已抵西安，这总算能让左宗棠松上一口气。

    左宗棠就陕甘目前的形势以及如何办理等事，给朝廷拜发了《敬陈筹办情形》及《筹拟购练马队》，又附《恳恩敕下杨岳斌、刘蓉悉力支持》一片，恳请朝廷自己未到任前，仍由二人主持大局，自己可以从容展布；抵任后，与二人共同维持局面，把陕甘两省的局势稳定下来。

    左宗棠以为，放刘蓉做陕西巡抚，一定比乔松年任巡抚更合适。刘蓉久经战场，颇知兵事玄妙，而且筹饷有方。左宗棠担心刘蓉革职回籍后，再难有出头之日。于公于私，都该上折奏留刘蓉、杨岳斌。

    但朝廷并不这么想，一个月后，圣旨下到大营，驳复了左宗棠奏留刘蓉的请求。圣旨以不容回旋的口气写道：“杨岳斌迭经有旨，责成将甘肃军务妥筹整理，准归该督调遣。刘蓉于捻踪入陕后，屡次催令出省，终以抗违，去冬灞桥之挫，已降旨将其革职，毋庸留陕，以为疲玩者戒。钦此。”左宗棠长叹一口气，只得作罢。

    转日，左宗棠着刘典统勇先期入陕，自己拟待马匹、枪械以及粮饷办理妥帖后，再拔营跟进。

    刘典离开汉口第五天，左宗棠又收到朝廷十万火急递来的圣旨，告以据陕西巡抚乔松年奏报，陕西形势危急，军心、民心日渐涣散，着其迅速入陕，勿在鄂停留。

    圣旨最后命令左宗棠：“该大臣务当先其所急，迅往镇压，并以屏蔽晋、豫，断不令遽行入甘，致碍该大臣种种布置。”

    左宗棠接旨色变，等传旨差官离去，便大骂道：“这个乔鹤侪，他这是发得哪门子神经？陕甘粮饷无出，不把粮饷料理妥当，你让几万大军怎么剿贼！陕省的事，是生生坏在他这个王八巡抚手里！本部堂到陕后，看怎么同他算账！”

    骂归骂，气归气，左宗棠又不敢不奉谕拔营。他只能一面西行，一面料理未尽事宜。途中，左宗棠陆续接到圣旨。

    一旨曰：“杨岳斌奏八旬老母病重，自身病亦增剧，恳请开缺回籍。着宁夏将军穆图善暂署陕甘总督，准杨岳斌交篆回籍。”

    左宗棠收到此旨苦笑不止，杨岳斌、刘蓉这两位同乡，他一位也没有留住。

    一旨曰：“裕瑞奉旨赴蒙古等地为入陕官军采办马匹已成，现已分起解赴陕甘总督衙门，交穆图善；富明阿奉旨已率麾下吉林马队五营，并新募年力精壮炮手千余名，拔营向陕西进发。”

    一旨曰：“两江协饷已由曾国藩、李鸿章派人送抵西安，四川、福建浙协饷已启运。”

    同治六年（公元1867年）四月初八，左宗棠率军抵达樊城。

    在樊城，左宗棠收到穆图善军情快报，称：“入侵新疆的中亚浩罕汗国帕夏阿古柏，已统率麾下安集延人，突然占领库尔勒以西地