国主义者侵入中国的关内。这时，日本军部的法西斯分子越发感到侵略中苏两国必须以细菌武器为有力武器的必要。于是，石井就强占以平房车站以北约4公里正黄旗屯为中心的2平方公里的耕地为建造兵营的工地，并在关东军军需部的指导下，奴役几千名中国劳动人民，大规模地修建了“细菌制造厂”。外围工程在1937年完成，1938年进入内部工程的阶段。石井为防止部队秘密外泄，特使他的同乡亲戚土木建筑业者铃木茂包办一切，所用的500多名服务人员，也是从故乡千叶县招募而来的。以活人作实验的“第七栋”、“第八栋”包括有大约120间独身监房，还有特殊试验室（冻伤研究室和供研究航空卫生用的减压试验室）、实验室、尸体解剖室、标本室以及种种杀人设备。“第三栋”、“第五栋”是培育细菌室，“第四栋”、“第六栋”是细菌孵化室。以上工程及设备陆续建成。

    1938年6月到1939年3月，731部队全部迁到平房镇。在所谓“南栋”（哈尔滨南岗）那里，只留下部队的“第三部”和“诊疗部”的基干，即检查病源、测验毒性、检查水质的各班和细菌制造班，滤过管制造班以及诊疗传染病的部分。在平房的这个部队，是拥有月产霍乱、伤寒等肠内细菌各500公斤、鼠疫菌250公斤、炭疽菌200公斤能力的皮带传送式生产设备，包含监狱的杀人实验所和研究初步细菌战争的机关，以及研究细菌的使用方法的机关等等在内的综合组织体。

    以该部队为中心，方圆八公里为半径的范围以内，划为特别地区。以“国境地带取缔法”和“军机保护法”为护符，从该处通往外部的各街道，即在双城街道、拉林街道、平房街道、阿城街道等各街道上，经常有伪警和宪兵严密监视。在这片土地内的23个村，1.2万农民都变成了731部队的奴隶。有440个贫、雇农被撵出村庄，集体关在该队北方附近的“劳工村”，在该队附近的“自养农场”内受奴役。对于其他的农民，则是每天强制出200名劳工和80辆大车以供差役。农民在打骂之下替他们耕种和从事土木工程以及搬运等繁重劳动，生活异常悲惨。

    731部队的“血清马”（供采取血清的马）吃燕麦，农民则以吃橡子来苟延残喘。小孩子不断饿死。有个青年因上山拾柴遇到宪兵，说他无许可证，致被打成半死，精神错乱。

    1939年5月，日本帝国主义因侵犯苏联哈桑湖边界，挑起哈桑湖事件。原想进窥苏联领土，不料遭到英勇还击，打了败仗。当时的关东军司令官植田谦吉曾派司令部第一课的参谋竹田东宫借查看的名义来到731部队，协商怎样进行细菌战以挽救战局。石井就派遣“碇部队”开往哈桑湖前线，将约有22公斤的伤寒、霍乱、副伤寒、赤痢菌撒布到哈尔哈河及其他水源、地上。当时虽然在日本侵略军中早作出预防的处置，尚且出现大量病人，至于在苏联、蒙古的军队里，在附近的居民中，有多少人受害，这是不难想像的事情。这次散播细菌，是731部队初次大规模的活动。在人类历史上，前所未有的、大规模的、不讲人道的细菌战争，就是这样开始出现的。可以说，731部队是以哈桑湖军事挑衅为转折点，从研究细菌战的准备阶段，进入了实行的阶段。在1944年，石井四郎因从事细菌战争的研究工作，得到日本陆军的最高技术有功奖。

    731部队的人员，也在1939到1940年之间骤然增加。哈桑湖事件以前，人数约500名。石井为防止秘密泄露，一向借军医学校的师生关系、亲戚关系和封建隶属关系来维持部队内的团结，掩盖罪恶活动。自从事件发生之后，更招募所谓“青年队”，组成了“子弟兵”，加强他的独裁力量（例如曾招募千叶县不满18岁的青年约70名）。此外，更致力从复员军人以及私人关系中寻求所谓可靠