拿下狱，严加追问。张信复阅结果与事实有悖，仍然无效，令礼部将全部试卷提交大内，待朕亲自披阅以定取舍，退朝。”说罢一拂袖，怒冲冲地走了，而刘三吾、张信等二十余人一齐被投进了刑部监狱。

    明朝初期的刑部，是朱元璋进行专制统治的一个得力工具。自建朝以来，在朱元璋的直接授意下，制造过许多大冤狱，其中仅洪武十三年杀宰相胡惟庸，并大抓所谓“胡党”和洪武二十六年杀大将军蓝玉又追查所谓“蓝党”两个冤案，就杀死了近三万人。刑部审案，有一套特别的方法，那就是用重刑逼供，什么“刷洗”、“秤竿”、“抽肠”、“剥皮”，还有“刺”、“”“劓”、“挑膝盖”、“锡蛇游”等等酷刑，叫人不死也得脱层皮，所以凡是下刑部狱的，一般是想定什么罪名，就能定什么罪名，刘三吾等人被投入监狱后，自然少不了刑讯逼供，但这几位大臣都是铮铮硬汉，尽管百般用刑，却没有一个胡说乱咬的，因而刑部想给他们定一个“同通会贿，私买贡生”的罪名就难以落案。案子审了十几天，还没有一点口供，而朱元璋却不断派人来催问结果，审案人着了慌，经过反复密议，想出了一个更狠毒的办法来。

    四月底，刑部突然派人抓了一大批与刘三吾、张信、白信蹈等人有过来往的人，并将各府家丁尽数抓捕入狱。一面用严刑逼供，一面设法暗示、诱导，使一些受不了酷刑的人开始按他们诱示的内容，供出刘三吾等人的种种不轨之举。在不到三天的时间里，就罗织了许多罪名，刘三吾、白信蹈曾与被杀的大将军蓝玉有较深的交往，这次被指控为“蓝党”，张信与阅卷官王侈华、张谏、严叔载等十余人，与蓝玉没有半点瓜葛，居然被扣上了一个“欲为逆臣胡惟庸鸣冤叫屈，反叛朝廷”的罪名。好在叛逆案只要有了指控的口供并不须要本人承认就可定罪，于是刑部很快将逼出来的口供录上报给了朱元璋。

    刘三吾等人被下狱后，朱元璋的日子也并不好过。他本是个创业的皇帝，对所有重大事件都是要经深思熟虑后才做决定的。会试案发后，他敏锐地感到，北方人在元朝统治下过了几十年，虽然受尽了压抑，但终究是大元朝遗民心对于新建的明王朝，总还有个观望、了解的过程，如果处不好关系，很可能使北方人把新王朝和元朝等同起来，产生一种敌对情绪，那样，北方就不好统治了。而北方又恰恰是大明朝的军事重镇，失去北方的人心，也就失去了北部边陲的安定，使新王朝随时受到威胁。因而利用科举考试笼络北方知识分子的人心，是有利于巩固新王朝的基础的。从整个大明朝的利益看，多录取一些北方举子本是完全必要的。但是刘三吾这个书呆子，只凭考卷文字去决定取舍，缺乏战略眼光，没有政治头脑，已使朱元璋感到不满。偏偏他又十分倔强，自恃阅卷的细致，连皇上的意旨也不放在眼里。最可恨的是张信，不但在大庭广众之下替刘三吾鸣冤，还敢肆无忌惮地当堂顶撞皇帝，使朱元璋几乎下不了台，这就促使朱元璋下决心一定除掉他们，以扑灭蓄藏在百宫中的不满情绪，同时为下一步改变录取名单，网络北方举子准备条件。所以他一再催促刑部要加紧审讯。

    今天，当他读到刑部关于刘三吾、张信等人定罪的报呈后，心中很是高兴。他绝不相信刘三吾、白信蹈是“蓝党”，尤其感到荒唐的是刑部给张信等人定了个“为胡惟庸鸣冤，反叛朝廷”的罪名，这个罪名说给谁听也不会相信。因为胡惟庸已被杀十七年了，哪有胡惟庸的余党在当时不反，而到胡惟庸尸骨早已朽烂之年才谋反的道理呢？但是，他还是昧着良心表彰了刑部，只将张信的“谋反朝廷”罪名用朱笔勾去，改定为“胡党”，然后亲自朱批了处理意见：张信、白信蹈，以及同科试官司宪、王侈华、张谏、严叔载、周衡、王揖等都凌迟处死，刘三吾因为担任过东宫讲官，与皇太子有师生之谊，且年事已高