，北暨宁波、上海、天津、牛庄，贩运之利，颇操其益，故郡中商务一时称盛。其后派运台米，配载班兵，船户苦之。积谷日多，遂有雇船官运之议，语在《粮运志》。续以蔡牵之乱，俶扰海上，凡十数年，商船多毁，于是至者日少，而渔船愈众。然渔船轻小，向不配差，口员照例仅查出入，积滞公文，数月不至。道光三十一年，巡道徐宗干议定，渔船兼配公文，以免阻遏。前时郡中有太平船二艘，专以运送兵丁骸骨并附客柩，招募郊商举充。废弃殆将千载，至是议兴之。

    通商以后，外货纷至，于是始有轮船，设船政厅以理之。同治七年十一月二十二日，总理各国事务衙门咨称：“本年九月初十日，据赫总税务司将引水章程十五条，改为引水新章十条，申送本衙门。于九月十五日，照会布俄、英、法、美、日各国驻京大臣去后，除日本国末接照复外，兹据布俄、英、法、美各国驻京大臣先后照复，允饬各口领事试办等因前来。除札知赫总税务司遵照外，相应抄录总税务司所改章程十条，咨行查照。”总督接后，即饬巡道遵办，于是复订台湾各口引水分章十条，与专条略有更改。十年，英船海轮始定台湾航路，以往来安平、淡水、厦门、汕头、香港，每两星期一回。其船尚小，载重仅二百七十七吨，而货客繁夥，获利厚。乃设得忌利士公司，以爹利士航行香、汕、厦、安，科摩沙、海龙、海门行于汕、厦、淡水，而台湾航业遂为所揽矣。

    光绪七年，巡抚岑毓英巡台后，以台地孤悬海外，非舟莫渡，商诸船政大臣，派拨琛航、永保两轮船，循环来往，以速文报，并准商人配货。是为官办之船。其搭客自安平至厦门，或自基隆、沪尾、艋舺至福州，每人三圆，自安平至福州及由台北至厦门者五圆，又自台南至台北者亦三圆。货物之■，则照招商局所定，酌减二成，一时颇杀外船之利。其后又增伏波、万年清两船，以速邮递，而载煤至上海者亦较多。法人之役，沿海被封，出入杜绝，唯帆船时得偷渡，然每遭击沉，往来殊险。十一年，巡抚刘铭传以飞捷、威利、万年清航行台湾及中国各港。十二年，设招商局于新加坡，又以三十二万两购驾时、斯美两船，往来上海、香港，远至新嘉坡、西贡、吕宋。而外船之载糖茶者多至日本、美国，太古轮船亦时一往来，于是航业渐盛。先是，光绪二年，帆船之至淡水者百十一艘，而轮船仅四十四艘。至十六年，则帆船减为八艘，而轮船增至百二十六艘，计有十七万七千五百余吨。盖自铭传治台以后，物产大兴，商务日盛，而航运亦受其利。

    初，铭传既筑铁路，筹疏基隆港，以连陆运。十三年，以林维源为总办，测量港道，拟自牛稠港至蚵壳港，括鲎屿于中，填平海岸，以建车站。又自小基隆至鲎屿，新筑市廛，建埠头，以接车站。其中安造铁桥，长十有二丈，为车马往来之道。惜功尚未竟，而解任去矣。旗后为台南商埠，港道稍隘，历任税务司叠请开凿，巡抚丁日昌亦奏请开浚，兵备道夏献纶禀请道办。而日昌以开浚之时，虑有三难：港底有石，一也；形势有碍，二也；经费太巨，三也。献纶复曰：“开港与挖煤不同，只将浮沙挖去，并无石隔，一免虑也。地方形势，既建炮台，可以防守，二免虑也。经费一途，可由台饷提用，似可裕如，三免虑也。且通商以来，中外遭风船只，时有所闻，如不开浚，设有洋船遭风之事，藉此要求，反落后着。故献纶以为开之便。”未行而献纶卒。张梦元接任，仍不欲办。遂以筹款未定，照会税务司，并禀总理衙门，以前开浚估价五万三千余圆，续估二十万四千余圆，为数太巨，拟照吴淞之例暂止。九年，安平英领事霍必澜以港道日塞，易致胶舟，递年险恶，现有浚港之船，为价不上五千圆，愿自发价疏浚，或由中国自办。不从。及铭传任巡抚，十六年夏五月，命英人马礼逊查勘，将大兴工事，以张贸易。未行而铭传去矣。