就在海会寺验尸后的第二天，京中浙江派官员大大松了一口气的时候，另一派官员却被惹恼了，并开始出面运动要坐实此案。

    这一派官员以四川总督丁宝桢为首，大部分人为两湖籍，并多为地方大员，被称为两湖派。丁宝桢并未受贿，他反对查办此案的理由很简单，不能为了区区一个举人就一下子处理这么多官吏。当然，这些将被处分的官吏大多是两湖籍人，自太平军事件后，两湖人在长江南北做地方官的人很多。

    两湖派纷纷上折子请求皇上（折子上称皇上，实为由两宫定夺）不要翻此铁案。丁宝桢上折子说，杨乃武风流成性，亦非善类，此是铁案，证据确凿，若是翻案，恐令天下的地方官寒心。

    大学士宝鋆是刘锡彤乡榜同年，也上折子说，人死已逾三年，毒气早就消失，毒消则骨白，怎么能够凭着骨是黄白色，即断定不是毒死是病死呢？

    云贵总督李宗羲上折曰：若因此案使浙江县、府、臬、藩、抚一大批官员受到处分，则谁谓天下太平耶？意思是这个案子要翻了，就是给大清国脸上抹黑。

    就连浙江巡抚杨昌睿竟也上了一个折子，说这个案子即使需要由刑部直接审理，也没必要将那么多所谓的证人都带到京中。使得江浙一带民心不稳，而且被传的证人也不能正常营生。意思是朝廷小题大作，滋扰民众。

    浙江派官员虽然大多是不掌实权，只管言论清议的京官，但也不甘示弱。纷纷上折子，针锋相对，弹劾杨昌濬、胡瑞澜等地方大员平日草菅人命，甚至某些封疆大吏更是目无朝廷，力请重加惩办。

    两派争吵不休，把个审案的刑部夹在中间，左右为难。

    刑部汉尚书桑春荣本是浙江绍兴人，受了京官浙江派的鼓动，一心要为家乡人出气，所以起先想认真查办此案。这个人年轻的时候是很有魄力的，曾经因平反大狱而享誉朝野，所以才能在一点家庭背景都没有的情况下，一直做到刑部尚书从一品大员的位置。但此时的桑春荣已经是七十四岁的老人了，年老颟顸，对此案本无主见，一任司官办理。别人说要平反，为浙江本籍人作些事情，他亦主张平反；丁宝桢跑到他面前气势汹汹的一吓，他又拿不定主张，再不敢出面参革了。对于本来已经审定应当参革各员的疏奏，一改再改，迟迟不向上交复。

    在这件案子中，刑部满尚书皂保心中本是没有什么偏倚的。只是因为汉尚书桑春荣当初要求严审，而且自己也觉的案子有冤，作为刑部尚书应当查清其中的隐情，所以开始查案的力度也很大。待两湖派和浙江派吵的不可开交时，他觉着自己偏着哪方都有些不当。倒把平冤的心思放下了，一心只想着自保。

    两个尚书都不想惹事，所以刑部平反的疏奏，从光绪二年一直拖到光绪三年，仍然迟迟不能上奏。

    光绪三年二月时，两派的矛盾终于激化。

    二月初十上午巳时二刻的时候（上午九点半），刑部衙门的中门突然被打开了。中门只有重要人物进衙的时候，才能够打开，这个重要人物不是别人，就是丁宝桢。

    丁宝桢带着几十名戈什哈，自己打开中门冲了进来。那些戈什哈，一个个着戎装挎佩刀，横眉立目，雄纠纠的走在刑部大院里。刑部里的京官们哪儿见过这阵势，不但不敢拦着，就是问也不敢问一声。

    早有人报了两位尚书，皂保一听丁宝桢又来了，急忙道：“这孙猴子又来捣乱，三十六计走为上，还是不招惹他的好。”拨了腿就从后门溜了。

    桑春荣也不含糊，知道自己腿脚慢，不能象皂保那样溜的快，急忙叫了一个随从，往他背上一趴，说声快走，也跑了。

    丁宝桢本是向两位尚书施压，让他们重审翻案的，但还是让这两个人溜走了。只好转回头来对着刑部官员一个个点着名字大