段的一面，同时也暴露了他在暴风骤雨般的局势中自信与经验的极度缺失。尘埃落定后，这位四川都督被袁世凯逮捕，以亏空公款的罪名判了9年有期徒刑。从他的为人处世方式看，袁世凯应当没有冤枉他。他的黑道手段遭到很多人的非议，同盟会员向楚、黄逐生说，尹昌衡所靠的哥老会等“三山五岳的朋友”为所欲为，“罗纶在尹昌衡挟持下，无所不为”。四川同盟会大佬但懋辛说：“因尹都督提倡袍哥，全城大街小巷，公口林立。奸淫占霸，时有所闻。”又说：“我认为尹是一个夸大狂的人，不愿与他同事而拒之。”尹昌衡的同学王右瑜说，尹氏煽动川籍军人利用袍哥等势力遂其野心。“只手打倒孔家店”的文化名人吴虞甚至在1914年的日记里说：“闻尹昌衡、罗纶、陶泽锟已于阴历正月十三日正法。果尔，大总统明见万里矣。”袁世凯死后，黎元洪特赦了尹昌衡。尹出狱后，退出政坛。1953年，病故于重庆，终年69岁。