为日本的几颗炸弹搬走这屋子，如嫌办公狭窄，你们可以迁移到铁道部地下室去办公，我不能离开这里，罗、刘两位副长官和我留在此地好了。”于是遵照唐生智的命令，卫戍长官司令部迁入铁道部地下室办公，但唐生智和罗卓英、刘兴两位副长官依然在唐公馆办公。

    在从衣兜中掏出手帕擦去冷汗之后，唐生智拿起一张早已经拟好的作战命令，稍咳嗽了一声，念道：“鉴于上述通报情况，南京卫戍司令长官部下达《卫参作字第二十八号》命令，指导意义为对我复廓阵地的防守进行部署。要求右侧支队固守板桥镇、戴山之线；第74军固守牛首山一带据点至河定桥之线；第88师固守雨花台；第71军之87师固守河定桥至孩子里、江南铁路北之线，右与88师及51师、左与教导总队联系；教导总队固守紫金山；第2军团固守杨坊山、乌龙山之线及乌龙山要塞；第36师固守红山、幕府山一带；第66军至大水关附近集结整理待命；第83军之156及36师之补充2团，在青龙山、龙王山线掩护撤退。令宪兵教导2团防守水西门至汉中门城垣阵地及城外上新河河堤阵地，令宪兵第2团防守城内清凉山，令宪兵第10团防守城内明故宫飞机场。”

    唐生智之所以这样命令，是因为南京卫戍司令长官部为集中兵力固守南京，同时亦因日军已经渗透入外廓阵地，故而一方面下令命第一线阵地守军退守复廓阵地，一方面命镇江的第103师、第112师及其附近的第3军迅速撤至南京。

    8日下午，第2军团的第48师已运抵南京，第83军的第156师也撤至南京，虽然其第154师仍在撤退途中，但这个时候对于唐生智及其统帅下的南京卫戍部队来说，集中兵力更有利于防御。

    另外，由于第三战区副司令长官顾祝同已经收容好上海撤下来的一部分军队开到扬州，并派参谋处副处长邵存诚还和南京方面保持着联系，不时通过电话询问南京的情形，同时也时常把扬州和江北的消息告诉南京方面，虽然江北方面的战争也一天一天地激剧起来，但是毕竟南京还没有彻底陷入合围，依旧可以通过江轮与江北战线联系。

    故而在12月8日白天，唐生智下令由卫戍长官司令部参谋处拟定了这个新的守城部署。由于南京卫戍长官司令部下令撤走镇江方面的守军，此时镇江要塞基本等于是放弃了防御。最初第87师是由师长沈发藻带领继续留驻镇江，与镇江要塞保持联系的，但日军紧逼镇江时，该师全部撤回南京，只留下第261旅驻守镇江，但陈颐鼎所部在12月6日也奉刘兴命令向南京撤退。

    这样在87师全部撤离镇江后，只有从江阴退回的第103师、第112师残部奉命守备镇江，但这两支部队在苦战数日，又奉命调回南京，这样一来，镇江要塞的防御基本空虚了。从12月5日晚，北固山哨所报告：“城外枪声四起，城内未见动静，但见西街商业区已起大火，烟雾冲天。”之后，留守镇江要塞的要塞参谋长王庚最初判断日军尚未进城，可能是友军撤退时放的火。

    但12月6日早晨，北固山哨所报告：“城内闻有鞭炮声，据查是汉奸迎敌进城。”又报“敌人已进城”。据此情况判断，王庚认为象山炮台成为敌人的后方，孤立无援，乃决定放弃象山炮台，在电话请示转移去江北的林显扬司令同意后，参谋长王庚立即下达撤退命令：要求象台迅即拆下炮闩及弹药、器材等，转移到都天庙炮台，协助都台继续抗敌；守备营第1连撤回荡田村高地，掩护象台渡江；第2连撤到合山西南高地，监视镇象公路情况，象台渡江后，工兵连立即渡江，占领都天庙两侧阵地，掩护都台，并抗拒敌军渡江；敢死队掩护指挥所人员渡江后，转移到焦台，归该台台长指挥，掩护炮台，继续作战；指挥所撤到都天庙附近，继续指挥焦台与都台作战。