1948年三四月份，进行了第二批整党。第二批整党主要是以县、区领导干部为主。整党期间，一、五地委分别召开了地委扩大会议，传达了邓小平给中共中央的电报、中央和中央分局关于纠正“左”倾错误的指示，讨论了对纠正“左”倾错误的安排和部署。各县委分别召开了区以上干部会议，结合本县实际情况，认真查找和纠正土改和整党工作中“左”的错误。当时，“左”的错误在本地的：表现与危害是：杀人过多，无严格控制，一度出现乱棍打死人，“爬望蒋杆”，对地主扫地出门，不给出路的现象。这样做，不仅基本群众不同情，而且把地主子弟及家属都推向国民党方面，使国民党地方政权、恶霸地主组织的“还乡团”武装迅速扩大，与解放区党政军民对抗，杀害地方干部和土改积极分子。组织路线过“左”。在土改中建立贫农团等组织时，把中农排除在领导班子之外，甚至提出中农不得扛枪当民兵，把多年的中农出身的积极分子、村干部统统踢开，一律换成贫雇农。贫雇农出身的干部多半与老干部关系密切，看老干部无罪受治，很不满意，工作中顾虑重重，放不开手脚。一些新出现的勇敢分子，一时又形不成核心，使党在农村中的威信有所降低，影响土改进行。土地分配政策上表现过“左”。按人口平均分配土地，侵犯中农利益，有些地方不仅“均”了中农的土地，而且分了他们的浮财，扩大了打击面。侵犯了工商业者的利益。对他们按土地算剥削帐，浮财被分，还打击了一部分大的工商业者。如驰名全国的杞县莫家酱菜作坊被捣了，几百条酱缸被打烂。整党中认为，出现上述问题的重要原因在于处于战争环境，党的政策不够完善，在小农经济基础形成的农民平均主义思想在县、区、乡各级干部中还严重存在。

    在整党中，为了纠正“左”的错误，地、县委逐级传达贯彻上级纠“左”的文件和指示精神，主要负责同志作检讨，主动承担责任，不上推、不下卸，并向被错误批判受伤害的干部和群众道歉。5—9月间，又先后进行几次整党，查挖地富思想、注意克服工作中“左”的情绪，纠正前段土改中侵犯中农利益，打击工商业者，杀人过多等“左”倾错误，消除“左”倾错误影响。虽然因战争频繁，使整党工作时断时续，但通过整党统一了认识，纠正了工作中的问题，加强了党的建设，推动了参军参战、支前及其他各项事业的发展。