8年4月，徐向前副师长率两个团和一个支队开赴冀南，并策划了进攻威县的战斗，给日军以沉重打击。陈再道则乘胜率东纵等部扩大战果，数次歼敌军于冀南周边的县镇，扩大了冀南根据地。几个月后，冀南地区南到成安、北到枣强、西至隆平、东至高唐的广大地区，均被我军占领，建立了巩固的抗日根据地。

    随着根据地的巩固，中共中央和北方局指示成立冀南行政公署和党委，为了加强地方武装，成立冀南军区，与东纵分开，陈再道仍任东纵司令。整编部队后，东纵辖有三个团。整编刚结束，陈再道接师部命令，率部发起了扫平漳河以南伪军和土匪的漳南战役。1938年8月30日夜，陈再道率东纵、青纵等主力向临漳守敌发起总攻，激战10天共歼敌4千余人，俘获伪军长李台及官兵共1100多人。战斗期间，日寇两次出动飞机轰炸我军，又派出汽车10余辆，满载日军200余人，对我骑兵团进攻，仍未能挽回伪军败局，反被重创，仓皇逃回安阳。之后，战斗向纵深发展，我军攻克滑县，最终歼敌7000多人，漳南战役取得重大胜利。

    1938年11月至1939年下半年，日伪军对冀南根据地进行了多次疯狂大扫荡，我军在冀南人民的支持配合下，狠狠地打击了日伪军，发起大小战斗四百余次，毙伤敌数万人，使日伪军不敢再入冀南根据地一步。

    1940年2月，我军在冀南开始了反击石友三的讨顽战役。石友三原为冯玉祥部下，曾任冀北保安司令，其部后被国民革命军改编为181师，石友三任师长，不久任扩编后的第69军军长、第10军团司令。他秉承蒋介石旨意，与我军对抗，制造摩擦，又发展到武装进攻，捕杀我游击队战士和抗日家属，同时与日寇勾结，配合日军扫荡我抗日根据地。对于这个顽敌，129师决定发动讨顽战役，痛打石友三部，以巩固冀南根据地。

    当时在冀南地区的顽军共有17000多人，我军出动了20多个团分成5路分别进攻和钳制敌军各部。陈再道和刘志坚负责指挥左翼队伍共十个团兵力，担任主攻任务。战前陈再道作了动员报告，部署了各部作战任务，提出了要求。会上群情激愤，战士们斗志昂扬，誓死为战友报仇，讨伐石友三这个叛逆。

    石友三闻讯率部秘密南逃，陈再道命各部迅速追堵，沿途击溃守敌，直逼石友三至威县东南的下堡寺、摇鞍镇一带。我军立即包围顽军所在地区，经五天五夜激战，歼敌两千余人，石友三则乘雪夜率残部西逃。这天夜晚，陈再道心绪不宁，夜间冒雪出门，想四处走走消除连日的疲劳。忽然发现雪地上有大车驶过的痕迹，正从两个村子之间辗过，立即亲率百余名骑兵跟踪追击。

    至凌晨，发现顽军在曲周东北的南北龙堂正准备西渡滏阳河。由于敌众我寡，陈再道命令骑兵部队严密监视敌人，待后续部队到达后再发动攻击。中午时分，东纵的两个团赶到，猛攻顽军阵地，石友三拼命抵抗，下午四时许，石友三率残部南逃。这时周边日伪军出动两千余人，掩护石友三，双方激战之时，石友三渡过滏阳河，逃窜而去。三月初，我军开始了第二次讨顽作战，陈再道改率中央纵队，主攻石友三部。第一天首战告捷，攻占了六塔集等地，继而击溃顽军反击，并切断石友三部与高树勋部的联系。

    3月5日，石友三部溃散，陈再道命部队分路追击，自己则亲率骑兵团穷追顽军主力至东明海头集。至3月11日，石友三率部逃过了陇海线，我军遂奉命后撤，回师再歼他敌数百人。两次讨顽战斗，我军打跑了石友三等部顽军，歼敌6500余人，缴获大量武器，我军伤亡也有两千多人，但最终取得了胜利，巩固了冀南、冀中以及鲁西、豫北地区的抗日根据地。

    1940年5月，129师决定将冀南军区和东纵合并，撤消东纵番号，划归