过罪生死得度经》与《药师琉璃光经》同本。据实观的《药师经义疏》谓有九卷《灌顶经》，即（一）、《灌顶二千神王护比丘咒经》。（二）、《灌顶十二神王护比丘咒经》。（三）、《灌顶三归五戒带佩护身咒经》。（四）、《灌顶白结神王护咒经》。（五）、《灌顶宫宅神王守护左右咒经》。（六）、《灌顶冢墓因缘四方神咒经》。（七）、《灌顶伏魔封印大神咒经》。（八）、《灌顶摩尼罗亶大神咒经》。（九）、《灌顶召五方龙王摄疫毒神咒经》。而十二卷《灌顶经》是加上（十）、《佛说灌顶梵天神策经》。（十一）、《佛说灌顶随愿往生十方净土经》。（十二）、《佛说灌顶拔除过罪生死得度经》等三卷。但《灌顶随愿往生十方净土经》一卷是后汉灵帝光和年中（西元一七八——一八三年）支谶所翻译的。而《佛说灌顶梵天神策经》有人以为是疑伪经。所以《灌顶经》的后三卷有可能是帛尸利蜜多罗的后人所附加。而十二卷《灌顶经》是《开元录》所记载，因此判断开元时代前所集成。

    三、本经的疑伪说

    《药师经》的疑伪说最早出现于僧佑的《出三藏记》卷五新集伪撰杂录第三，其中说到：‘《灌顶经》一卷：一名《药师琉璃光经》，或名《灌顶拔除过罪生死得度经》；右一部宋孝武帝大明元年秣棱鹿野寺比丘慧简依经抄撰。’而且因为慧简所抄撰之经，与东晋帛尸梨蜜多罗译的《佛说大灌顶神咒经》第十二《拔除过罪生死得度经》为同一经，故本经亦怀疑为疑伪经。

    但从内容观察，疑伪说之论证，显然证据不足。

    四、本经之内容

    本经一开始是（一）序分。佛在毗舍离国广严城乐音树下说法。尔时文殊菩萨请佛演说诸佛名号及大愿功德，令闻者业障消除，以利乐像法诸有情等。

    （二）明本誓利益——十二大愿章：佛告文殊：去此东方十殑伽沙佛土，有净琉璃世界，佛号药师琉璃光如来十号俱足。彼佛于行菩萨道时，曾发利乐有情之十二大愿。

    （三）果德章：说明药师佛土之庄严，与极乐世界等无差别。其国一向清净无有女人、恶趣。有无量菩萨众，而以日光遍照、月光遍照二大菩萨为上首。

    （四）佛号功德章：明听闻及忆念佛号之种种功德。因听闻及忆念药师佛号能使布施、持戒、精进、忍辱诸波罗蜜速得圆满。亦能解脱一切魔难、咒术、障碍，恒生善道。

    （五）八大菩萨章：明佛弟子若能长时受持八分斋戒者，以此善根愿生西方极乐世界无量寿佛所，而未能决定者；若听闻药师佛的名号，临命终时，佛遣文殊师利菩萨、观世音菩萨、得大势菩萨、无尽意菩萨、宝檀华菩萨、药王菩萨、药上菩萨、弥勒菩萨等八大菩萨，示其道路，极乐化生。

    （六）转女成男章：若为女人，至心持念药师佛号，能得转女成男。

    （七）药师真言章：演说药师真言及其种种功德、使用方法。

    （八）文殊章：文殊菩萨誓于像法时，以种种方便，令诸净信得闻药师佛名号。若能称扬药师名号及受持此经，则四大天王及其眷属将供养守护。且能免除一切横死，及诸恶鬼神侵扰等。

    （九）阿难章：佛问阿难，是否信解药师佛之功德。阿难言：‘我于如来所说契经，不生疑惑。’

    （十）救脱菩萨章：救脱菩萨问佛：诸众生为病患所困，死相现前，琰魔法王与俱生神交涉时，如何解脱？佛告以病人亲属、知识，若能为彼皈依药师如来，读诵《药师经》，燃七层之灯，悬续命五色神旛，供养药师佛，经七日、二十一日、三十五日或四十九日，彼神识得还。救脱菩萨复对阿难说明，续命旛灯造法；及帝王如何解脱治国之七难，而得七福。复次救脱菩萨复对阿难解说，供养药师佛可脱离九种横死。

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