。4月，新四军军部决定组建先遣支队，深入苏南敌后，实施战略侦察，开展游击战，为主力部队开路，他要求参加。先遣支队司令员粟裕开始不同意，他去找第一支队司令员陈毅，未见到便留下一封信，信中恳切地写道：“说明我的志愿，我正式地辩明我是一个通讯员，我负有‘重要’任务，有伟大的历史使命的先遣支队的出动，及它以后如何在敌人的前后左右进行工作的情形，我非常迫切要求了解。”又提出他懂得一点日语，可以做一点对敌军的宣传工作。尔后他见到了陈毅，陈司令笑着说：“不错，你这个通讯员实在非跟着走不可。”他终于如愿，作为新四军先遣支队的一名战士，随粟裕直插敌后，与敌刀兵相见于苏南战场。7月下旬，陈毅率领的新四军一支队和张鼎丞率领的二支队先后挺进苏南敌后，先遣支队与一支队合并，他调到一支队政治部任敌工科长兼陈毅司令的对外秘书，随陈毅开辟茅山抗日根据地。

    在新四军一支队，他先后参加了丹阳、延陵、珥陵和黄桥战役。作为新四军的一员，他战斗在抗日战场上，英勇顽强、不畏牺牲。同时，他以火一样的战斗热情，用笔反映了新四军和抗日根据地人民与日伪军的斗争。比如：他在距离火线仅70公里的地方写了《向敌人的腹背进军》；他写的报告文学《截击》，及时向中国人民报告了新四军进入江南敌后对日寇第一次作战所取得的辉煌胜利。他亲自参加了拔掉京杭要道上的日军强固据点东湾的战斗，并很快根据战斗实况写了报告文学《东湾——日军据点的毁灭》。他的出色表现，他的出色工作，受到党的重视，得到人民和战士的肯定。陈毅司令在给军政治部主任袁国平的电报中肯定了他对党和人民的忠诚。他的报告文学集《向敌人的腹背进军》收集了他随新四军深入江南敌后所写的作品，由新四军军部出版后受到前方战士和后方人民的欢迎，称他为“人民的作家，一位正视现实的武装的战士”。

    1940年11月，中共中央中原局决定在盐城筹办鲁迅艺术学院华中分院，邱东平为筹备委员之一。他为筹办鲁艺华中分院积极地工作。1941年2月初的一个雪后初晴的下午，鲁艺华中分院在盐城贫儿院旧址召开了成立大会，会上，新四军政治委员刘少奇、代军长陈毅讲了话，他报告了筹备经过。院长由刘少奇兼任，他被任命为教导主任。分院设在盐城贫儿院旧址和附近的兜率寺，学员来自四面八方，除从华中各抗日根据地来的，还有跋涉千里，通过重重封锁、冒着生命危险从敌占区、国统区以及海外投奔来的热血青年。这里生活艰苦、条件简陋，教学器材和师资力量不足，邱东平和师生们一起，整理环境，挑土修路，堆垒舞台，同大家一起吃玉米糊糊和红高粱，一起睡地铺，他还亲自给文学系讲课。学校师生们边教边学，边创作边实践，经常深入到部队、农村和学校中去演出，作宣传。在不到半年的时间里，他们创作和演出了《皖南一家》、《重庆交响乐》等许多剧目，除戏剧演出外，学音乐的学员常到连队或学生中去教歌，学美术的走上街头画墙头画和在街头开办抗战画展，学文学的写报道，出墙报，写街头诗。在苏北抗日根据地，鲁艺华中分院不仅是一所为革命培育文艺干部的学院，而且是一支很有战斗性的抗日宣传队伍。

    邱东平担负繁重的教务和教学工作，并没有停止创作。他开始创作一部以新四军开辟茅山抗日根据地为题材的长篇小说，军长陈毅还批准他创作假赶写。陈军长对他说，我读过你的文章，老实说，成百上千的战士好找，要想找你邱东平这样的作家，很不易啊！当他告诉陈毅军长，他的这部长篇小说取名《茅山下》时，陈毅赞赏说，好，茅山傲然不屈的峰峦，正象征着我们新四军健儿伟岸的英姿。他要求东平赶快写，陆续送给他看……

    抗战中，情况瞬息万变。1941年7月20日开始，