同治十三年（1874年）十二月初五日，同治帝崩于皇宫养心殿。同治皇帝驾崩后，慈禧太后指定同治皇帝的堂弟载湉继承皇位。载湉接位后，慈禧太后垂帘听政，于1875年3月27日（光绪元年二月二十日），改帝号（年号）为光绪。从同治十三年十二月到光绪元年二月，京内各部，都忙着丧事和登基，把一应事情，都搁置下来。杨昌睿总算有了一口喘息的机会。杨乃武虽然未曾受刑，但从此在杭州监中一呆就是近半年。直到第二年三月，此案才开始接着审理。

    但杨昌睿仍然不愿翻案，此案又不能动刑，一审再审不能定案。京中的杨增生见时间拖延的久了，也怕生出变故，便找左都御史广寿商量。广寿也觉的此事不便过久担搁，便让都察院刑科给事中王书瑞给慈禧上了一道折子，说杨乃武案中，浙江巡抚办案居心不公，偏听偏信，接到知府陈鲁所交案后，不加根究就转呈刑部，草菅人命。去年奉旨重审此案时，又委派湖州知府锡光代理审案，意图卸责，对此重大案件，久悬不决，迄今不能查明。奏请钦派大员，秉公查办以雪奇冤而成信谳。

    慈禧也觉的这个案子拖的太久了，从同治十二年（1873年）十月十一日案发，到光绪元年（1875年）四月，历时一年半不能审明，便于四月五日下旨：“所奏已准，浙江余杭县民妇葛毕氏毒毕其夫葛品连诬攀举人杨乃武因奸同谋一案，着派浙江提督学政胡瑞澜严讯，以期水落石出。学政胡瑞澜即刻启程专赴浙江杭州，亲审杨乃武一案，查实内中是否有冤枉之处。”

    又批示刑部，在浙江遴选官员陪审。

    这个胡瑞澜，正是去年十月斥革杨乃武举人功名的浙江学政。此人做官，虽然炭冰之敬来者不拒，往来馈送，一概接纳。但却是从不在官司、学政等上面作弊收钱的，所以落了个清正的名声。胡瑞澜作官向来奉的是不偏不倚，不关己事宁可糊涂，关己之事一定明白的原则。杨乃武之案中，他不经查证，一怒之下就将杨乃武的功名革去，还写下“正身洁已己，不以财色经怀；敦品励行，当以作人为先。”二十个字晓谕全省学子，也正是他不关己事，宁可糊涂的结果。

    钦差胡瑞澜陛辞之后，即行就道，到杭州去。临行之时，左都御史广寿亲自叮嘱，说这个案子十有八九是冤枉的，千万要审理清楚，不能再抱官官相护宗旨。胡瑞澜一口应诺，承诺一定不负所托，方才出京。叶菊贞也知道京中派了钦差大臣去审此案，以为这一次总能昭雪杨乃武的罪名，便住在京中，等候消息。

    胡瑞澜到了杭州已是五月，船还未到码头，早有人报知巡抚各官，在码头上迎接，一个个跪请了圣安，方同钦差相见。当下胡瑞澜便在巡抚择定的地点打了公馆。当日点了该案的陪审官，分别是宁波知府边葆诚，嘉兴知县罗子森，还有两个分发在浙江的候补知县，顾德恒和龚世潼。

    杨昌睿听说是要派钦差审案，心中一惊，恐怕自己官位不保。后来听说了是胡瑞澜作了审案钦差，却放下心来。原来二人同在浙江作官多年，论私交是没说的。而且胡瑞澜去年革了杨乃武的功名，今年若是为杨乃武翻了案，岂不是自打嘴巴。又听说陪审官中有宁波知府边葆诚的名字，更是窃喜。原来，边葆城是杨昌睿湖南老乡，又是刘锡彤的姻亲，当然不会向着杨乃武。

    除了杨昌睿外，臬台蒯贺荪不久前病死于杭州，尚未有人接任；湖州府知府锡光等人因是奉命审案，又没有收受贿赂，倒不怎么惊慌；只将杭州知府陈鲁和余杭县刘锡彤吓得手足无措。

    刘锡彤单为了这个案子，已经花去了八九万两银子，虽是妻子带过来万贯家财，仍是肉疼的很。这一回听说钦差要来，只好又叫妻子拿出十万两银子，以做打点之用。陈鲁见了却道：“这位学政大人可送不得。”

    刘锡彤奇道：